Nová analýza nedávneho prepuknutia infekcie Clostridium difficile (CDI) na Slovensku ukázala, že v posledných rokoch prevládali špecifické ribotypy C. difficile.¹

Tím pod vedením Adriany Plankaovej, Oddelenie klinickej mikrobiológie, Unilabs Inc. Epidemiológia CDI v slovenských nemocniciach po objavení sa ribotypu 176 v roku 2016.

V priebehu rokov sa prevalencia niektorých ribotypov mohla zmeniť.

„Ribotypizované údaje zo Slovenska“. Jim tvrdo Izoláty z rokov 2011 až 2013 vykazovali nízku diverzitu ribotypov a jasnú dominanciu RT001; Jim tvrdo RT176 v tom čase nebola rozpoznaná,“ ​​napísali autori. Neskôr, v roku 2016, bolo hlásené veľké ohnisko 75 prípadov RT176 CDI v stredisku terciárnej starostlivosti v severnej časti Slovenska. V tom istom roku spolu 36 nemocníc na Slovensku sú v národnom monitoringu CDI a zabezpečuje aj 12 nemocníc Jim tvrdo izoláty na charakterizáciu“.

V štúdii výskumníci aplikovali monitorovací protokol ECDC CDI v2.3 na 14 nemocníc v rokoch 2018-2019. Tím zhromaždil ďalšie údaje o nedávnom používaní antimikrobiálnych látok a charakterizácii izolátov C. difficile.

Výsledky ukazujú incidenciu CDI v jednotlivých nemocniciach 4,1 prípadu na 10 000 postelí pacientov s fatálnym koncom v nemocnici 27,6 % (n = 105) z 381 prípadov. Za predchádzajúce 4 týždne bola antimikrobiálna liečba zaznamenaná v 90,5 % (n = 333) prípadov.

V 50 % prípadov (n = 185; 14 nemocníc) bol zistený rRNAtyp 176, zatiaľ čo RT001 bol zistený v 34,6 % (n = 128; 13 nemocníc) prípadov s údajmi rRNA, vyšetrovatelia zistili aj 86 % (n = 318) prípadov izoláty boli rezistentné na moxifloxacín Thr82Ile v GyrA (99,7 %).

Výskumníci vykonali multivariantnú rekurentnú metaanalýzu a zistili fylogenetické spojenie s prevládajúcimi RT v rámci nemocníc a medzi nimi.

Polovica zo 14 nemocníc sekvenovala izoláty RT176, zatiaľ čo 5 z 13 izolátov RT001 vykazovalo len 0–3 rozdiely alel podľa wgMLST.

Väčšina sekvenovaných izolátov – 24 z 27 – niesla gén erm (B). Okrem toho sa uskutočnilo 16 sériových izolátov AAC (6′) – Av (2′) Gén so zodpovedajúcimi antimikrobiálnymi fenotypmi.

Bolo tiež 9 kmeňov RT176, ktoré otehotneli CFRNesúci gén (E) a jeden kmeň RT001 CFRc) gén. Boli však bez lineárneho odporu.

„Novo dominantný RT176 a endemický RT001 poháňajú epidemiológiu CDI na Slovensku,“ píšu autori. „Okrem fluorochinolónov môže byť ďalšou hnacou silou šírenia týchto epidemických kmeňov použitie antibiotík makrolid-linkozamid-streptogrén B. Pri C. difficile musí byť rezistencia na linezolid fenotypovo potvrdená u kmeňov s detekciou génu cfr.“ (s).“

Plankaová, A., Brajerová, M., Čapek, V., Novotná, GB, Kinross, P., Skalová, J., Šoltésová, A., Drevinek, P., & Krutová, M. (2023). Infekcia C. difficile bola na Slovensku v rokoch 2018–2019 prevažne spôsobená difficile gRNA 176 a 001 rezistentnými na fluorochinolóny. International Journal of Antimicrobial Agents106824. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.106824.