Varianta, kmeň a mutácia v SARS-CoV-2 znamenajú rôzne veci – technické novinky, Firstpost

Keď „pani Rona“, známa ako koronavírusy, oslavuje svoje prvé narodeniny od vstupu do nášho života, zvýšil sa dopyt po pojmoch ako pandémia, osobné ochranné prostriedky, protilátky, antigény atď., Ktorá je dnes súčasťou našej každodennej slovnej zásoby. Mnoho z nás teraz rozumie zložitému procesu vývoja vakcíny, klinickým skúškam, ktoré prechádza, a regulačným schváleniam, ktoré môže potrebovať pred zavedením. Žili sme a učili sa.

Pretože SARS-CoV-2 rýchlo „mutoval“, v mnohých častiach sveta sa objavili nové „varianty“ vírusu. V ére pred COVID-19 sme mohli použiť tento nový kúsok informácií na to, aby sme ohromili priateľov alebo rodinu pri večeri alebo koktailoch. Ale buďme úprimní, je nepravdepodobné, že príslušné premenné to čoskoro umožnia.

Ďalej sa ponoríme a pochopíme základné …

Čo je vírus?

Pred pandémiou COVID-19 sme záhadne počuli o vírusoch spôsobujúcich choroby, ako je ebola v Guineji a Kongu, o prasacej chrípke alebo vtáčej chrípke v Indii a Rusku, AIDS atď., A teraz vieme, že príčiny SARS-CoV-2 Ochorenie COVID-19.

Podľa správy z Scientific AmericanPo mnoho rokov vedecká komunita diskutovala o definícii vírusu; Najskôr ako jed, potom životná forma a potom biochemická.

Dnes sú vírusy niekde medzi živým a neživým organizmom.

a vírus Skladá sa z jadra genetického materiálu (DNA alebo RNA) obklopeného ochrannou vrstvou proteínu. Môžu sa pripojiť k hostiteľským bunkám a pomocou mechanizmov hostiteľskej bunky množiť jej genetický materiál. Akonáhle je tento proces replikácie dokončený, vírus opustí hostiteľa buď pučaním alebo z bunky, pričom ho v procese zničí.

Vírusy sa samy nemôžu rozmnožovať, ale akonáhle sa naviažu na hostiteľskú bunku, môžu prosperovať a ovplyvňovať správanie hostiteľskej bunky spôsobom, ktorý hostiteľovi škodí a prospieva vírusu.

Čo je to kmeň?

Kmeň podľa správy V. KonverzáciaJe odlišne konštruovaný variant, ktorý vykazuje odlišné fyzikálne vlastnosti a správa sa odlišne od pôvodného vírusu. Tieto rozdiely v správaní môžu byť jemné alebo zjavné.

READ  Objavte „Toho, kto vyvoláva strach“ - bol objavený nový mimoriadne silný predátor, ktorý sa živí mäsom

Koronavírusy, ako napríklad ťažký akútny respiračný syndróm koronavírus 2 (SARS-CoV-2), sú posiate proteínovými „mutáciami“, ktoré sa viažu na receptory v bunkách obetí. SARS-CoV-2 je teraz jedným z mála ďalších známych kmeňov v rodine koronavírusov, vrátane vírusov SARS a MERS.

Odborníci sa domnievajú, že pojem plemeno je často zneužívaný.

„Existuje jeden kmeň koronavírusu. Je to SARS-CoV-2. Toto je jediný kmeň a existujú rôzne typy tohto kmeňa.“ Nezávislý Citovala profesora Toma Connora z Fakulty biologických vied na Cardiffskej univerzite.

Čo je to mutácia?

Vírus sa skladá zo sekvencie buď DNA, alebo RNA, čo je v podstate séria nukleotidových písmen, ktoré kódujú gény vo všetkom živom. Akákoľvek zmena týchto písmen sa nazýva mutácia a nastane, keď sa vírusová sekvencia opakuje. Mutácie sa vo víruse vyskytujú veľmi náhodne – skutočnosť, ktorá by v prípade pandémie mohla fungovať pre nás alebo proti nám. Mutácia môže byť pre vírus prospešná a zosilnená, alebo môže byť škodlivá a znížiť jeho virulenciu.

SARS-COV-2, na rozdiel od chrípkového vírusu, obsahuje proteín známy ako korektúrny enzým. Enzým je podobný ako editor novinových kópií, ktorý kontroluje pravopisné chyby na stránke. Tento enzým vykoná opravy na základe pôvodnej vírusovej sekvencie. Preto, ak dôjde k nejakým zmenám, ktoré nastali v dôsledku náhodnej mutácie, pokúsi sa ich opraviť.

Rovnako ako editor ľudských kópií, niekedy mutácia vkĺzne cez korekčný enzým a zostane. Pri množení mutantnej vírusovej častice sa replikuje celý jej genóm vrátane mutačného miesta a prenáša sa do ďalších generácií vírusu.

Ako sa teda dá zistiť, či došlo k mutácii vírusu? Tu prichádza na rad virológ. Virológovia neúnavne pracujú na sledovaní všetkých premenných, ktoré infikujú ľudí. Na porovnanie so zmenenými variantmi koronavírusu sa používa pôvodný vírus, ktorý sa nachádza vo Wu-chane.

READ  SpaceX vymieňa motor „podozrivej“ kozmickej lode v rekordnom čase

Aká je alternatíva?

Zjednodušene povedané, „variant je verzia vírusu, ktorá nahromadila dostatok mutácií, aby predstavovala samostatnú vetvu v rodokmeni,“ Hovorí Odborník na infekčné choroby Dr. Amish Adalja je vedeckým pracovníkom v Centre pre zdravotnú bezpečnosť Johna Hopkinsa.

Každá mutácia a kmeň vírusu je variantom, ale každý variant nie je kmeňom.

Väčšina variantov nie je dôvod na obavy. Je to preto, že mutácie nespôsobili nijakú drastickú zmenu príslušného vírusu. Ak sa však vyskytne skupina mutácií, môžu niekedy ovplyvniť spôsob, akým sa vírus chová, šíri alebo infikuje ľudí. To je prípad, keď sa premenná stane „premennou záujmu“. Klasickým príkladom sú nové varianty, ktoré sa šíria po častiach Spojeného kráľovstva, Afriky a Brazílie.

Vedci pozorne sledujú varianty SARS-CoV-2, aby pochopili, ako môžu genetické zmeny vírusu ovplyvniť infekciu (a tým aj jej šírenie), závažnosť ochorenia, liečbu a účinnosť dostupných vakcín. Hovorí Dr. Thomas Russo, profesor a predseda katedry infekčných chorôb na univerzite v Buffale v New Yorku.

Aké sú nové premenné v obehu?

Typ SARS-CoV-2 známy ako B.1.1.7 sa šíri po Veľkej Británii od decembra 2020 a prípady sa teraz objavujú po celom svete. Vedci našli určité dôkazy o tom, že tento variant má zvýšené riziko úmrtia v porovnaní s ostatnými variantmi.

Graf hovorí o najnovšom rozširujúcom sa variante SARS-CoV-2. Image credit: Európske centrum pre prevenciu a kontrolu chorôb

V Južnej Afrike sa objavil ďalší SARS-CoV-2 známy ako B.1.351. Má určité podobnosti s britským variantom a môže tiež opätovne infikovať ľudí, ktorí sa zotavili z iných variantov COVID-10. Existujú tiež dôkazy, že vakcíny AstraZeneca a Moderna nie sú účinné proti tomuto variantu.

Variant známy ako P.1 sa objavil v Brazílii a bol prvýkrát objavený u ľudí cestovanie Z juhoamerickej krajiny do Japonska. Existujú určité dôkazy, že tento variant by mohol ovplyvniť spôsob interakcie protilátok s vírusom. Mutácia vo variante P.1 bráni protilátkam v rozpoznávaní a neutralizácii vírusu.

READ  Will Axiom Space provide an alternative to a commercial space station for NASA's International Space Station?

podľa CDC, Všetky tri varianty zdieľajú špecifickú mutáciu nazývanú D614G, ktorá umožňuje jej rýchlejšie šírenie.

S novými variantmi, ktoré sa neustále objavujú, je dôležité byť na vrchole sekvenčnej hry genómu. Týmto spôsobom budeme schopní vytvoriť nové varianty záujmu o verejné zdravie (pretože môžu byť nákazlivejšie, spôsobovať vážnejšie choroby a vyvinúť vakcínu alebo imunitnú rezistenciu) a môžeme ich vylepšiť. Ignorovanie týchto nových mutácií ich však nenechá odísť a z dlhodobého hľadiska by pre nás mohli byť škodlivé.

So vstupom od S Krishnaswamy, Emeritný profesor bioinformatiky na Fakulte biotechnológie Univerzity Madurai Camarrage

Pridaj komentár

Vaša e-mailová adresa nebude zverejnená. Vyžadované polia sú označené *