Pre redaktora:

V posledných mesiacoch sa omikrón (B.1.1.529) stal dominantným variantom koronavírusu 2 ťažkého akútneho respiračného syndrómu (SARS-CoV-2), ktorý vykazuje určitý stupeň imunitného úniku.¹ Primárne subvarianty omikrónu, BA.1 a BA.2, sú postupne v mnohých krajinách vytláčané BA.5, pravdepodobne v dôsledku zvýšenej prenosnosti a čiastočného imunitného úniku spôsobeného BA.1 a BA.2.^2,3 Ochrana poskytovaná BA.1 proti infekcii subpremennou BA.5 je kritická, pretože adaptované vakcíny v klinických skúškach sú založené na BA.1.

Portugalsko bolo jednou z prvých krajín ovplyvnených dominanciou BA.5. Na výpočet rizika infekcie BA.5 medzi subjektmi s dokumentovanou infekciou predchádzajúcimi variantmi vrátane BA.1 a BA.2 sme použili Národný register pre koronavírusovú chorobu 2019 (Covid-19) (SINAVE). Register zahŕňa všetky prípady hlásené v krajine bez ohľadu na klinický obraz.

Postava 1. Postava 1. Ochranný účinok predchádzajúcej infekcie SARS-CoV-2 na infekciu variantom Omicron BA.5.

Ako je znázornené na paneli (a), identifikovali sme obdobia (v rôznych farbách), v ktorých bol jeden variant zastúpený vo viac ako 90 % izolátov vzorky (údaje z národného ťažkého akútneho respiračného syndrómu koronavírusu 2). [SARS-CoV-2] kontrola genetickej diverzity⁴). Obdobia v sivej farbe predstavujú časy, keď bolo v obehu viac ako jedna premenná. Vzhľadom na relatívne pomalý prechod medzi dominanciou omikrónového variantu BA.1 a dominanciou omikrónového variantu BA.2 sme v analýze spojili BA.1 a BA.2. Nezahrnuli sme žiadne subjekty infikované počas 90 dní pred dominanciou subfaktora omikrón BA.5. Panel B ukazuje účinnosť ochrany proti infekcii počas kontrolného obdobia BA.5 (od 1. júna 2022) medzi jedincami s jednou infekciou v obdobiach dominancie rôznych variantov, ako je znázornené v paneli A, v porovnaní s jedincami bez zdokumentovanej infekcia od 1. júna. Ľudia s infekciou pred 1. júnom neboli do štúdie zaradení. 𝙸 Stĺpce predstavujú 95% intervaly spoľahlivosti.

Národný genetický dohľad nad SARS-CoV-2 identifikoval obdobia, v ktorých rôzne varianty predstavujú viac ako 90 % izolátov.⁴ Identifikovali sme všetky subjekty, ktoré mali svoju prvú infekciu v kontrolných obdobiach pre každú premennú, aby sme vypočítali riziko infekcie počas kontrolného obdobia BA.5 (Obrázok 1a). Zlúčili sme BA.1 a BA.2 kvôli pomalému prechodu medzi týmito dvoma subpremennými v populácii. Nakoniec sme vypočítali riziko BA.5 pre populáciu, ktorá nemala žiadnu zdokumentovanú infekciu pred dominanciou BA.5 (1. júna 2022).

Zistili sme, že predchádzajúca infekcia SARS-CoV-2 mala ochranný účinok proti infekcii BA.5 (Obrázok 1b a Tabuľka S1 v Doplnkovej prílohe, ktorá je k dispozícii s úplným znením tohto listu na NEJM.org) a táto ochrana bola maximálna pri predchádzajúcej infekcii BA.1 alebo BA.2. Tieto údaje by sa mali zvážiť v kontexte penetračnej infekcie vo vysoko zaočkovanej populácii, keďže viac ako 98 % skúmanej populácie v Portugalsku dokončilo základnú očkovaciu sériu pred rokom 2022.

Návrh štúdie nemôže eliminovať všetky mätúce faktory (pozri sekciu diskusie v doplnkovej prílohe). Okrem toho je jedným obmedzením predpokladaný účinok zníženej imunity v populácii s heterozygotnou imunitou (predchádzajúca infekcia a očkovanie). Zistili sme, že infekcia BA.1 alebo BA.2 u očkovaných jedincov poskytuje vyššiu ochranu proti BA.5 ako infekcia preomikrónovými variantmi, čo je v súlade s nedávnou správou o negatívnom teste.⁵ Infekcie BA.1 alebo BA.2 sa však vyskytli bližšie k obdobiu dominancie BA.5 ako infekcie skoršími variantmi. Existuje názor, že ochrana, ktorú poskytuje predchádzajúca infekcia BA.1 alebo BA.2, je veľmi nízka, vzhľadom na veľký počet infekcií BA.5 medzi osobami, ktoré boli predtým infikované vírusom BA.1 alebo BA.2. Naše údaje naznačujú, že toto vnímanie je pravdepodobne výsledkom väčšej skupiny subjektov s infekciou BA.1 alebo BA.2 v porovnaní s infekciou inými podpremennými a nie je podporované údajmi.

Celkovo sme zistili, že penetrujúce infekcie s variantom BA.5 boli menej pravdepodobné u ľudí s predchádzajúcou anamnézou SARS-CoV-2 vo vysoko zaočkovanej populácii, najmä v prípade predchádzajúcich infekcií BA.1 alebo BA.2, ako u neinfikovaných jedincov. .. .

Joao Malato, MA.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko

Roy M. Ribeiro, Phil D.
Národné laboratórium Los Alamos, Los Alamos, Nové Mexiko

Pedro P. Leite, MUDr
Pedro Casaca, MUDr
Eugenia Fernandez, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Carlos Antunes, Ph.D.
University of Lisboa, Lisabon, Portugalsko

MUDr.Válter R. Fonseca, PhD.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Manuel C. Gomez, Ph.D.
University of Lisboa, Lisabon, Portugalsko

Luis Graca, MD, Phil D.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko
[email protected]

Táto správa bola odoslaná 31. augusta 2022 na NEJM.org.