Sci Rep.2021 14. októbra; 11 (1): 20494. doi: 10,1038/s41598-021-99661-7.

Krátke zhrnutie

Vznik nového variantu SARS-CoV-2 B.1.1.7 vyvolal globálny poplach v dôsledku zvýšenej prenosnosti, úmrtnosti a neistoty ohľadom účinnosti vakcíny, čím sa urýchlilo úsilie o detekciu a vysledovanie variantu. Súčasné metódy na detekciu B.1.1.7 zahŕňajú sekvenovanie a testy RT-qPCR, ktoré obsahujú cieľový test, ktorý zlyhá alebo má za následok zníženú citlivosť na variant B.1.1.7. Pretože mnohým krajinám chýbajú programy genetického sledovania a neúspešné testy detegujú nesúvisiace varianty s podobnými mutáciami ako B.1.1.7, použili sme alelovo špecifickú polymerázovú reťazovú reakciu a pozične LNA-modifikované nukleotidy na vývoj testu RT-qPCR, ktorý odlišuje B .1.1.7 presnosť a rýchlosť ostatných variantov SARS-CoV-2. Test sme validovali na 106 klinických vzorkách s potvrdeným stavom pôvodu a vykonali sme celonárodnú štúdiu sledovania prevalencie B.1.1.7 na Slovensku. Multiplexovaný test RT-qPCR ukázal klinickú citlivosť 97% a znova testoval 6 886 pozitívnych vzoriek na SARS-CoV-2 získaných počas troch kampaní uskutočnených do jedného mesiaca, čo odhalilo rozsiahlu prevalenciu B.1.1.7 s priemerom 82% rozšírenia. Laboratóriá môžu tento test ľahko implementovať s cieľom rýchlo rozšíriť úsilie dohľadu B.1.1.7 a je obzvlášť užitočné v krajinách s vysokou prevalenciou variantov, ktoré majú deléciu ΔH69/ΔV70 iba preto, že súčasné stratégie používajúce testy zlyhania cieľa ich nesprávne identifikujú ako domnelé B 1,1 7. Premenné.

PMID:34650153 | DOI:10,1038/s41598-021-99661-7